Investigar características genéticas, marcadores de diferentes tipos celulares (linfoide, mesenquimal, neural), de diferenciação e de células-tronco em amostras de tumores de pacientes brasileiros e sul-americanos.

Analisar os marcadores e vias de sinalização em banco dados transcriptomas disponíveis, como Gene Expression Omnibus e ArrayExpress;
Verificar se há associações entre o perfil de marcadores de identidade celular e diferenciação em tumores de Ewing e o prognóstico e características clínicas:
o marcadores neurais tais como Beta-III tubulina, receptor AMPA de glutamato (GluR1), receptores NMDA (NR1, NR2B), nestina, TrkA e TrkB;
marcadores mesenquimais tais como CD34, CD105, CD44, CD99 vimentina;
marcadores linfoides tais como CD19, CD45, LCA, CD3, CD20, CD43, CD79a, TdT e CD10;
marcadores mieloides tais como CD33, CD179a/b, CD123 BDCA-1/2/3, langerina, CD1a e CD14
marcadores de células-tronco tais como CD133, Oct4, Sox2, Nanog, Bmi1 e Kif4
Caracterizar os transcritos de fusão em de tumores de Ewing brasileiros e sulamericanos por hibridização por fluorescência in situ (FISH), reação de polimerase em cadeia por transcriptase reversa (RT-PCR), microarranjos e sequenciamento, e explorar suas relações com as características clínicas;
Avaliar os números de cópias de 1q e 16q em tumores de Ewing e suas relações com fatores prognósticos e desfechos clínicos;
Identificar novas combinações entre fatores de crescimento e deles com moduladores epigenéticos para controle de diferenciação neural ou mesenquimal de células de sarcoma de Ewing;
mapeamento dos marcadores (neurais, linfoides, mieloides, mesenquimais e de células-tronco) antes e após o tratamento de linhagens celulares, cultivo primário e tumoresferas com inibidores de HDAC e fatores de crescimento (NGF, IGF, EGF, BDNF) sozinhos ou em combinação
Caracterizar funcionalmente linhagens celulares, culturas primárias e culturas enriquecidas de células-tronco-tumorais (tumoresferas) em termos de capacidade de viabilidade, sobrevivência, proliferação, cicio celular, apoptose e migração após o tratamento com inibidores de HDAC e fatores de crescimento (NGF, IGF, EGF, BDNF) sozinhos ou em combinação;
Verificar os efeitos de ligantes de receptores de fatores de crescimento, proteína quinases e enzimas relacionadas à regulação epigenética sobre a sobrevivência, proliferação e migração de células de sarcoma de Ewing;
Avaliar a expressão de possíveis alvos moleculares tais como IGFR, MAPKERK, PI3k, mTor/Akt, vias Hippo e YAP em amostras de Sarcoma de Ewing;
Realizar testes pré-clínicos em modelo de tumores xenográficos com os tratamentos que serão previamente identificados nos objetivos anteriores in vitro.

Pesquisa